Lundi 16 avril 2012
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21:38
Le génotypage des chevaux de GenEndurance a été effectué sur une puce spécifique équine dotée de 74 000
SNP. Une puce est une plaque de verre ou de silicium sur laquelle ont été apposés de petits fragments d’ADN caractéristiques de l’espèce. Chaque séquence d’ADN voisine d’une variation
caractéristique nommée SNP (Single Nucleotide Polymorphism) constitue un marqueur. L’analyse du génome s’effectue donc sur 74 000 points répartis sur toute la molécule d’ADN. L’ADN testé (du
sang) s’hybride avec le fragment complémentaire présent sur la puce et ce produit est multiplié en présence d’éléments fluorescents. Ces éléments fluorescents permettent à l’ADN hybridé d’émettre
un spot ; en fonction de la couleur du spot et de son intensité il est possible de déterminer l’allèle présent sur ce SNP. Le génotypage permet donc de connaitre les allèles de chaque cheval
sur 74 000 SNP.
La puce équine SNP 50 contenant 54,602 SNP par
échantillon
et qui permet l’analyse de 12 échantillons en
parallèle (link)
Lecture d’une puce au scanner à
fluorescence
Chaque point de couleur correspond à 1 SNP – la
couleur indique si l’individu est homozygote (2 allèles identiques) ou hétérozygote (2 allèles différents) pour ce marqueur (link)
Par genendurance
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Lundi 16 avril 2012
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21:09
Le génotypage de 588 chevaux de 7 ans et plus ayant des performances en course
d’endurance à vitesse libre est maintenant terminé.
Le génotypage permet de déterminer la structure génétique d'un
organisme, et plus particulièrement la nature d’une (ou plusieurs) variation(s) génétique(s) à une position spécifique dans le génome, pour un individu donné.
Il s’effectue sur l’ADN issu des cellules (du sang dans le cas des chevaux
GenEndurance). L’ADN est la molécule support de l’information génétique ; il est présent dans toutes les cellules. Les gènes sont des portions d'ADN
qui déterminent un caractère héréditaire (la couleur de la robe par exemple). Un même gène peut exister sous des formes différentes appelées allèles. Pour chaque gène, un individu possède deux
allèles, un issu de la mère et l’autre issu du père ; ceux-ci peuvent être identiques ou différents
Le génotypage permet de connaitre les allèles de chaque cheval sur de
multiples points répartis sur l'ensemble du génome (SNP). Pour plus de détails, voir Le
génotypage : comment çà se passe?
Il faut ensuite mettre en œuvre une lourde analyse statistique pour identifier les SNP et combinaisons de SNP associés aux critères d’intérêt.
Dans le cadre du programme GenEndurance, il s’agit des caractéristiques phénotypiques (conformation, taille, couleur de la robe…) et des critères de performance ou contre performance en course
d’endurance (distance parcourue, vitesse en course, éliminations…).
L’étape ultérieure consistera à déterminer les gènes correspondant aux SNP intéressants
afin de comprendre par quels mécanismes biologiques ils sont favorables ou défavorables à la performance en endurance.
Par genendurance
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Lundi 19 mars 2012
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21:16
La première communication issue du projet GenEndurance a eu lieu le 1er mars 2012 dans le cadre de la Journée de la Recherche Equine à Paris (link).
Ont été présentés les résultats de la mise en relation des mesures morphologiques simples (hauteur au garrot, longueur corporelle, périmètre thoracique, note d'état corporel) et du niveau de
performance. Des résultats préliminaires encourageants qui seront dans quelques mois étoffés par l'étude morphométrique réalisée à partir des photos des chevaux. Par ailleurs, le seul critère de
performance retenu pour cette 1ère étude a été le niveau de course sur lequel chaque cheval était qualifié car moins de 2 tiers des chevaux mesurés en 2011 avaient déjà un indice
endurance (calculé sur les performances en épreuves à vitesse libre en 2010 et avant) ; ce critère classique n'a donc pas pu être utilisé.
Ci-dessous le poster affiché à la Journée de la Recherche Equine.
Par genendurance
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Lundi 19 septembre 2011
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21:48
Connaître le poids d'un cheval est utile pour adapter au plus juste les traitements prophylactiques (vermifuges) ou curatifs, et ainsi éviter les
sous-dosages, principaux responsables du développement de résistances (anthelminthiques, antibiotiques), ou les surdosages potentiellement toxiques.
La méthode la plus fiable pour connaître le poids d'un cheval est bien sûr la balance. Mais cet objet est coûteux et n'est souvent disponible que dans les écuries importantes ou les
cliniques vétérinaires.
Pesée sur la première manip GenEndurance à Fontainebleau
De nombreuses méthodes d'estimation du poids à partir de mesures corporelles ont été décrites chez le cheval. Leur précision dépend du nombre de mesures utilisées. A notre connaissance, il
n'existe aucune équation adaptée au cheval d'endurance. Le programme GenEndurance nous donne l'opportunité de mesurer et peser de nombreux chevaux et donc d'établir des équations d'évaluation du
poids pour les Arabes et croisés Arabe.
Voici l'une des équations que nous avons établie. Elle nécessite de mesurer la hauteur au garrot (HG en cm), la longueur entre la pointe de l'épaule et la pointe de
la fesse (LC en cm) et le périmètre thoracique au passage de sangle (PT en cm).
Poids (kg) = 2,70 HG + 0,74 LC + 3,1 PT – 670,82
Pour suivre l'évolution du poids du cheval au cours de la saison, il suffit ensuite de mesurer uniquement le périmètre thoracique, HG et LC ne variant pas chez le cheval adulte.
Cette équation n'est pas valable chez les jeunes chevaux (ils n'ont pas encore complètement sorti leur garrot). Nous devrions pouvoir vous proposer des équations adaptées
aux chevaux de 4 à 6 ans après les prochaines séances de mesure.
Rendez-vous à Uzès pour les finales SHF : vous pourrez faire peser vos chevaux et contribuer à l'établissement de ces nouvelles équations.
Par genendurance
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Lundi 5 septembre 2011
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21:56
La 1ère partie du protocole GenEndurance touche à sa fin. L'objectif était de recueillir des prélèvements sanguins, mesures, photographies et enregistrements d'allures sur plusieurs
centaines de chevaux ayant des performances sur des épreuves à vitesse libres.
Après Compiègne et Monpazier, le nombre de chevaux examinés dépasse maintenant les 350, dont 342 sujets avec des prélèvements sanguins.
Un grand merci à tous les cavaliers et propriétaires qui nous ont présenté leurs chevaux.
La 2ème partie du protocole GenEndurance sera consacrée à l'étude des jeunes chevaux. L'objectif est de valider sur une population nouvelle les résultats obtenus sur la population
adulte et de tester l'intérêt prédictif des paramètres mesurés.
Rendez-vous à Uzès pour le début de cette nouvelle étape...
Vous êtes sûr que je dois poser? J'ai mieux à faire...
Par genendurance
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